大林慈济医院位于台湾嘉义县大林镇，是嘉义县重度急救责任医院，致力于高龄化与偏乡医疗照护，1992年成立肿瘤中心暨整合性肿瘤特别门诊。目前台湾卫生福利部核准兴建的质子治疗中心集中在北中和南都会区，云嘉南地区相对匮乏。大林慈济医院质子治疗中心建成后将使台湾云嘉南地区患者免于南北舟车奔波，缩短治疗等待时间，提升患者医疗品质。

台湾地区已运营质子治疗中心两家，分别为林口长庚纪念医院质子治疗中心、高雄长庚纪念医院质子治疗中心;在建质子治疗中心两家，分别为台北医学大学台北癌症中心质子治疗中心、台湾大学医学院质子治疗中心;拟建质子治疗中心一家，为台湾彰化基督教医院质子治疗中心。