上海市质子重离子医院临床诊疗效率的不断提高，得益于医院专家团队经验的不断积累以及“本土化”诊疗方案的持续优化。医院从会用到用熟，再到用好，质子重离子放疗的“中国经验”日渐丰富、成熟。

目前，该院专家团队将收治适应证、诊疗流程、患者入组条件等纳入标准化、规范化管理并不断完善和升级;促成上海质子重离子放疗临床标准规范(SOP)已更新至64项(第十版)，成为国内质子重离子放疗领域的临床应用操作指南。